Recent Publications  

 

Image 1



Research


Editor for the Following Journals


Biological Systems Analyzed by SAnDReS

Below you have a list of biological systems (datasets) that were analyzed using SAnDReS. Each zipped folder has the necessary files to reproduce the results reported for each dataset. See tutorial page for additional information about these files.

     -Coagulation Factor Xa with Ki Information   ZIP   PubMed   
     -Cyclin-Dependent Kinases with IC50 Information   ZIP   PubMed   
     -Cyclin-Dependent Kinases with Ki Information   ZIP   (to be published)   
     -High-resolution Structures with Delta G Information   ZIP   Link     
     -High-resolution Structures with IC50 Information   ZIP   PubMed     
     -HIV-1 Protease with Ki Information   ZIP   PubMed   

Project Datasets     

Below you have a list of biological systems being investigated using SAnDReS.

-3-enol-pyruvoylshikimate-5-phosphate synthase (EPSP synthase) (EC 2.5.1.19)   PubMed    IC50   Kd   Ki
-11-Beta-Hydroxysteroid Dehydrogenase (EC 1.1.1.146)   PubMed   IC50   Ki        

-Acetylcholinesterase (EC 3.1.1.7)   PubMed   MOTM   IC50   Kd   Ki   
-ADAM 17 Endopeptidase (EC 3.4.24.86)   PubMed   IC50   Kd   Ki    
-Adenosine A2a Receptor (EC 3.2.1.17)   PubMed   IC50   Kd   Ki           
-Adenosine Deaminase (EC 3.5.4.4)   PubMed   IC50   Ki    
-Adenosylhomocysteinase (EC 3.3.1.1)   PubMed    IC50   Ki   
-Aldehyde Reductase (EC 1.1.1.21)   PubMed   IC50   Kd   Ki    
-Angiotensin-Converting Enzyme (EC 3.4.15.1)   PubMed   IC50   Kd   Ki    

-Beta-2 Adrenergic Receptor (EC 3.2.1.17)   PubMed   IC50   Kd   Ki   
-Beta-Glucocerebrosidase  (EC 3.2.1.45)   PubMed   IC50   Ki   
-Beta-Lactamase (EC 3.5.2.6)   PubMed   MOTM   IC50   Kd   Ki   
-Beta-Secretase 1 (EC 3.4.23.46)   PubMed   MOTM    IC50   Kd   Ki   

-Carbonic Anhydrase II (EC 4.2.1.1)   PubMed   MOTM   IC50   Kd   Ki     
-Caspase-3 (or Apopain) (EC 3.4.22.56)   PubMed     MOTM   IC50   Kd   Ki    
-Catechol O-Methyltransferase (EC 2.1.1.6)   PubMed   IC50   Ki    
-Chorismate Synthase (EC 4.2.3.5)   PubMed   Kd   
-c-Jun N-Terminal Kinase 3 (EC 2.7.11.24)   PubMed   IC50   Kd   Ki   
-Coagulation Factor X (EC 3.4.21.6)   PubMed    IC50   Kd   Ki   
-Coagulation Factor VIIa (EC 3.4.21.21)   PubMed   IC50   Kd   Ki    
-C-X-C Chemokine Receptor Type 4 (EC 3.2.1.17)   PubMed   IC50   Kd   Ki    
-Cyclin-Dependent Kinase (EC 2.7.11.22)   PubMed   IC50   Kd   Ki    
-Cyclooxygenase-1 and 2 (EC 1.14.99.1)   PubMed   MOTM   IC50   Kd   Ki   
-Cytochrome P450 2C9 (EC 1.14.13.-)   PubMed   MOTM   IC50   Kd   Ki   

-Dihydrofolate Reductase (EC 1.5.1.3)   PubMed   MOTM   IC50   Kd   Ki
-Dihydroorotate Dehydrogenase (EC 1.3.5.2)   PubMed   IC50   Ki       
-Dipeptidyl Peptidase IV (EC 3.4.14.5)   PubMed   IC50   Kd   Ki       
-Dopamine D3 Receptor (EC 3.2.1.17)   PubMed   IC50   Kd   Ki    
-Dual Specificity Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase 1 (EC 2.7.12.2)   PubMed   IC50   Kd   Ki           

-Enoyl-[Acyl-Carrier-Protein] Reductase (NADH) (EC 1.3.1.9)   PubMed   IC50   Kd   Ki       
-Epidermal Growth Factor Receptor ErbB1 (EC 2.7.10.1)   PubMed   MOTM   IC50   Kd   Ki  

-Farnesyl Diphosphate Synthase (EC 2.5.1.10)   PubMed   IC50   Kd   Ki             
-Fibroblast Growth Factor Receptor 1 (EC 2.7.10.1)   PubMed   IC50   Kd   Ki           
-FK506-Binding Protein 1 (EC 5.2.1.8)   PubMed   IC50   Kd   Ki           
-Focal Adhesion Kinase 1 (EC 2.7.10.2)   PubMed   IC50   Kd   Ki           

-GAR Transformylase (EC 2.1.2.2)   PubMed   Ki          
-Glucocorticoid Receptor (EC 2.3.1.48)   PubMed   IC50   Kd   Ki          

-Hepatocyte Growth Factor Receptor (EC 2.7.10.1)   PubMed   IC50   Kd   Ki              
-Hexokinase Type IV (EC 2.7.1.2)   PubMed   Kd   Ki           
-High-Resolution Crystallographic Structures   DeltaG   IC50   Kd   Ki     
-Histone Deacetylase (EC 3.5.1.98)   PubMed   IC50   Kd   Ki                  
-HMG-CoA Reductase (EC 1.1.1.34)   PubMed   IC50   Kd   Ki           
-Human Immunodeficiency Virus Type 1 Integrase (EC 2.7.7.-)   PubMed   MOTM   IC50   Kd   Ki   
-Human Immunodeficiency Virus Type 1 Protease (EC 3.4.23.16)   PubMed   MOTM   IC50   Kd   Ki              
-Human Immunodeficiency Virus Type 1 Reverse Transcriptase (EC 2.7.7.49)   PubMed  MOTM   IC50   Kd   Ki          
-Hydrolases (EC 3.-.-.-)   PubMed   IC50   Kd   Ki        

-Insulin-Like Growth Factor I Receptor (EC 2.7.10.1)   PubMed   IC50   Kd   Ki          
-Isomerases (EC 5.-.-.-)   PubMed   IC50   Kd   Ki          
 
-Kinases (EC 2.7.-.-)   PubMed   IC50   Kd   Ki         

-Leukotriene-A(4) Hydrolase (or LTA-4 Hydrolase) (EC 3.3.2.6)   PubMed   IC50   Kd   Ki        
-Ligases (EC 6.-.-.-)   PubMed   MOTM   IC50   Kd   Ki             
-Lyases (EC 4.-.-.-)   PubMed   IC50   Kd   Ki        
      
-Macrophage Colony Stimulating Factor Receptor (EC 2.7.10.1)   PubMed   IC50   Kd   Ki        
-MAP Kinase-Activated Protein Kinase 2 (EC 2.7.11.1)   PubMed   IC50   Kd   Ki       
-MAP Kinase (EC 2.7.11.24)   PubMed   IC50   Kd   Ki    
-Matrix Metalloproteinase 13 (EC 3.4.24.-)   PubMed   IC50   Kd   Ki       
-Monoamine Oxidase B (EC 1.4.3.4)   PubMed   IC50   Kd   Ki       
-Muscle Glycogen Phosphorylase (EC 2.4.1.1)   PubMed   MOTM   IC50   Kd   Ki         

-Nitric-Oxide Synthase (EC 1.14.13.39)   PubMed   MOTM   IC50   Kd   Ki         
-Neuraminidase (EC 3.2.1.18)   PubMed   MOTM   IC50   Kd   Ki   

-Oxidoreductases (EC 1.-.-.-)   PubMed   IC50   Kd   Ki            

-Peptide Deformylase (EC 3.5.1.88)   PubMed   IC50   Kd   Ki               
-Peroxisome Proliferator-Activated Receptor (EC 2.3.1.48)   PubMed   IC50   Kd   Ki     
-Phosphodiesterase 5A (EC 3.1.4.35)   PubMed   IC50   Kd   Ki           
-Phospholipase A(2) Group IIA (EC 3.1.1.4)   PubMed   IC50   Kd   Ki        
-Poly [ADP-ribose] Polymerase-1 (EC 2.4.2.30)   PubMed   IC50   Kd   Ki            
-Protein Farnesyltransferase/Geranylgeranyltransferase Type I Alpha Subunit (EC 2.5.1.58 or EC 2.5.1.59)   PubMed   IC50   Kd   Ki        
-Protein Kinase C Beta (EC 2.7.11.13)   PubMed   IC50   Kd   Ki            
-Purine Nucleoside Phophorylase (EC 2.4.2.1)   PubMed   IC50   Kd   Ki         

-Renin (EC 3.4.23.15)   PubMed   IC50   Kd   Ki    
-Rho-Associated Protein Kinase 1 (EC 2.7.11.1)   PubMed   IC50   Kd   Ki    
-Serine/Threonine-Protein Kinase AKT(EC 2.7.11.1)   PubMed   IC50   Kd   Ki     
-Serine/Threonine-Protein Kinase AKT2 (EC 2.7.11.1)   PubMed   IC50   Kd   Ki    
-Serine/Threonine-Protein Kinase B-raf (EC 2.7.11.1)   PubMed   MOTM   IC50   Kd   Ki       
-Serine/Threonine-Protein Kinase PLK1 (or Polo Kinase) (EC 2.7.11.21)   PubMed   IC50   Kd   Ki     
-Serine/Threonine-Protein Kinase WEE1 (EC 2.7.10.2)   PubMed   IC50   Kd   Ki     
-Shikimate Kinase (EC 2.7.1.71)   PubMed   Kd   Ki    
-Stem Cell Growth Factor Receptor (EC 2.7.10.1)   PubMed   IC50   Kd   Ki     

-TGF-Beta Receptor Type I (EC 2.7.11.30)   PubMed   IC50   Kd   Ki     
-Thymidine Kinase (EC 2.7.1.21)   PubMed   IC50   Kd   Ki    
-Thymidylate Synthase (EC 2.1.1.45)   PubMed   IC50   Kd   Ki    
-Thrombin (or Fibrinogenase) (EC 3.4.21.5)   PubMed   IC50   Kd   Ki    
-Transferases (EC 2.-.-.-)   PubMed   IC50   Kd   Ki     
-Trypsin I  (EC 3.4.21.4)   PubMed   IC50   Kd   Ki      
-Tryptase Beta-1 (EC 3.4.21.59)   PubMed   IC50   Ki        
-Tyrosine-Protein Kinase (EC 2.7.10.2)   PubMed   IC50   Kd   Ki       

-Urokinase-Type Plasminogen Activator (EC 3.4.21.73)   PubMed   IC50   Kd   Ki    

-Vascular Endothelial Growth Factor Receptor 2 (EC 2.7.10.1)   PubMed   IC50   Kd   Ki  


Last updated on December 4th 2017 by Ms. Gabriela Bitencourt Ferreira.